本苗栗原隸新竹醫師公會，自民國三十八年苗栗設治後，於民國三十九年間，由本會先進邱雲賜醫師等十餘人發起組織籌備委員會從事籌備工作，同年十二月二十日成立苗栗縣醫師公會，並經苗栗縣政府40.3.9府氏社自字第16號令核准立案。

本會首任理事長由邱雲賜醫師擔任，當時本會會址設於苗栗縣衛生院。嗣因業務需要，於民國四十年間經徵得前故理事長劉家樑醫師概允，遷至其開設之博濟醫院內辦公，自此本會會務逐漸步入正軌。民國五十七年十一月十九日在任理事長(第四、六屆)劉家樑醫師不幸逝世，經接任前故理事長葉律明醫師同意，於民國五十八年二月十二日遷至其開設之葉婦產科診所辦公至本會於民國七十二年七月六日遷入新購置會館止。

本會新會館之購置，乃歷任理事長鑑於本會長期寄居或隨理事長更迭搬遷而無固定會址，對於會務之連繫有諸多不便，且會員日增，會務月鉅，於有限之經費尊節積存基金新台幣貳佰餘萬元，加上當時由洪理事長率理監事及總幹事，不辭辛勞，犧牲醫療業務，挨戶向會員募捐，幸蒙會員熱心支持，而募得壹佰餘萬元始成，戮力經營，誠非易事。

本成立四十年來，在歷任理事長暨理監事之通力合作，秉公領導及總幹事之負責推展下，會務蒸蒸日下，舉凡協助政府推行政令。公共衛生、舉辦貧民義診，防癌抹片義診，為會員代購麻醉藥品及藥用酒精，舉辦學術演講會，舉辦會員包括春自強旅遊運動，發動會員愛國捐獻及社會救濟運動。故省公會於民國六十五年開始頒贈獎勵以來，本會歷年都獲頒優等獎牌，便於民國六十五年、六十六年、六十八年獲頒省政府獎狀激勵。